Vết tối, hình elip (với kích thước ban đầu là 13.000 × 6.600 km, hoặc 8.100 × 4.100 mi) của GDS-89 có kích thước tương đương Trái đất và có hình dạng tương tự như Vết đỏ lớn của sao Mộc. Xung quanh các cơn bão, gió được đo lên tới 2.100 kilômét trên giờ (1.300 mph), ghi nhận là nhanh nhất trong Hệ mặt trời. Vết Tối Lớn được cho là đại diện cho một lỗ hổng trên tầng mây mêtan của sao Hải Vương. Điểm được quan sát tại các thời điểm khác nhau với kích thước và hình dạng khác nhau.

Vết Tối Lớn đã tạo ra những đám mây trắng lớn ở hoặc ngay dưới đỉnh tầng đối lưu [2] tương tự như độ cao của những đám mây ti được tìm thấy trên Trái đất. Tuy nhiên, không giống như các đám mây trên Trái đất được tạo thành từ các tinh thể băng, các đám mây ti của sao Hải Vương được tạo thành từ các tinh thể metan đông lạnh. Và trong khi các đám mây ti thường hình thành và sau đó phân tán trong khoảng thời gian vài giờ, các đám mây trong Vết Tối Lớn vẫn xuất hiện sau 36 giờ, hoặc hai lần quay của hành tinh.

Các vết tối của sao Hải Vương được cho là xảy ra trong tầng đối lưu ở độ cao thấp hơn so với các đặc điểm trên tầng mây trên.[3] Vì chúng là các cấu trúc ổn định có thể tồn tại trong vài tháng, chúng được cho là có cấu trúc xoáy.[4]